工程施工三级科目设置包括以下几个方面：

成本科目。主要包括人工费、材料费、机械使用费、其他直接费和间接费用等，需要将其记入对应的工程施工二级科目。

结算科目。主要是指按照工程进度结算的金额，需要记入对应的工程施工二级科目。

减值科目。工程施工在资产负债表日存在可变现净值或者合同估计价款低于成本情形的，应当按照规定计提存货跌价准备，并计入存货减值损失科目，最终转入工程施工减值准备科目。

以上就是工程施工三级科目的主要设置内容，通过这些设置，可以帮助企业更好地管理工程项目的成本和进度。

工程施工三级科目设置的注意事项包括：

1. 严格按照公司要求设置，确保科目设置与公司业务内容相符。

2. 确保科目设置简洁明了，方便使用和管理。

3. 及时更新科目内容，确保数据的准确性和完整性。

4. 注意科目之间的关联和逻辑关系，确保账务处理的合理性和清晰性。

5. 遵守公司财务制度的规定，对于三级科目的设置和使用，需要遵守相关制度和流程，确保合规性。

6. 考虑到成本效益的平衡，在设置三级科目时，需要考虑到数据的完整性和准确性，同时也要考虑成本效益原则，避免设置过多的科目导致数据冗余和系统复杂化。

总之，工程施工三级科目的设置需要考虑到公司的业务特点、数据完整性、成本效益原则和合规性等多个方面，以确保账务处理的合理性和准确性。

工程施工三级科目设置说明如下：

1. 工程施工下设的科目包括工程成本、间接费用、间接成本和税金等。其中，工程成本是用于核算工程施工过程中发生的各项施工成本，包括各项材料费、人工费以及施工机械使用费等；间接费用是指企业所属施工、生产单位（以下称分支机构）为组织和管理施工生产所发生的各项费用，包括管理人员的工资、奖金、职工福利费、办公费、差旅费、财产保险费、工程保修费、排污费等；间接成本则是企业所属各施工单位为组织和管理施工生产活动所发生的支出；税金则包括企业根据国家税法规定应计入工程成本的有关税金。

2. 工程施工的设置目的主要是通过三级科目的设置，对工程项目的施工成本进行分析和核算，以便于企业更好地控制施工成本，提高经济效益。同时，通过对工程施工过程的管理和监督，及时发现和解决施工过程中的问题，确保施工质量和安全。

3. 在使用过程中，可以根据企业的实际情况，对工程施工的科目进行适当的调整和补充。比如，可以增加“其他直接费用”和“应付福利费”等科目，用于核算企业施工过程中发生的除人工费、材料费、施工机械使用费等直接成本以外的其他相关费用。

以上即为工程施工三级科目设置说明，建议查阅更多资料，获取更详细的信息。