货物运输合同印花税的计算方式是，按照运输合同金额的千分之一计算缴纳。

印花税是对经济活动和经济交往中书立、领受具有法律效力的凭证的行为所征收的一种税。根据《印花税暂行条例》规定，购销合同包括供应、预购、采购、购销结合及协作、调剂、补偿、易货等合同，按购销金额万分之三贴花。

如果需要更具体的信息，可以咨询税务部门。

货物运输合同印花税的相关信息如下：

1. 印花税是对经济活动和经济交往中书立、领受具有法律效力的凭证的行为所征收的一种税。

2. 货物运输合同包括民用航空运输合同、国际货物运输合同、国内货物运输合同，都需要缴纳印花税。

3. 对于记载资金的货物运输合同应按运费的金额由纳税人根据规定计算缴纳印花税。

在实际操作中，具体还需咨询税务部门了解更多细节。

货物运输合同印花税常见问题主要包括以下几个方面：

1. 计税依据：货物运输合同以运费收入计算缴纳印花税，包括运费、装卸费、保险费等。通常，运费收入作为主要收入，装卸费和保险费根据实际支出情况支付。

2. 税率问题：印花税的税率是固定的，对于货物运输合同，税率通常为万分之五。这意味着每份货物运输合同需要缴纳的印花税等于合同金额乘以税率。

3. 是否包含在增值税中：货物运输合同中的运费收入是计入增值税应纳税额的，但印花税的计算并不受增值税的影响。

4. 免税政策：根据相关规定，对于符合一定条件的货物运输合同，可以享受免征印花税的优惠政策。具体条件和申请程序应咨询当地税务机关。

5. 跨地区问题：如果货物运输合同涉及多个地区，印花税的计算可能会因地区差异而有所不同。建议在具体计算前咨询当地税务机关或专业人士。

此外，如果货物运输合同丢失，一般情况下，如果已贴花但未满一个月，可以向税务机关提出申请；如果已满一个月但未满一年，可以提出撕毁作废合同，但需要向税务机关说明原因。

请注意，以上信息仅供参考，具体问题可能因具体情况而异，建议咨询专业人士以获取更准确的信息。