上海医药高等专科学校成立于2005年9月，由上海市人民政府批准建立。学校位于南汇周浦地区的上海国际医学园区内，占地面积达384亩，建筑面积10万平方米，可容纳4000多名学生。学校的新校区计划于2006年9月正式启用。

学校的教育理念是“素质为先、技能为本、医技为主、全面发展”，旨在培养具有高素质的实用型高级卫生职业技术人才。学校面向上海及全国各省市招收高中毕业生、“三校生”（中专、职校、技校生），文理兼收，提供高质量的全日制高等教育。毕业生不仅获得国家统一颁发的高职学历文凭，还获得多张职业技能证书，就业率超过98%，就业单位遍布本市各级医院、医药企事业单位等。

学校现有专职教师111名起步网校，其中高级职称教师占比33.3%，形成了一支高素质的“双师型”师资队伍。目前，学校拥有来自美国、英国、澳大利亚、日本等国的18名常驻外籍教师，与多国合作开展教育教学交流项目。学校还与芬兰、荷兰、挪威、日本等国的学生进行长期或短期交流，并每年派出师生赴这些国家讲学或学习。

学校紧跟社会经济的发展，力求满足医疗卫生事业对卫生职业技术人才的需求。目前开设的专业包括护理学、护理学（中美合作）、护理学（口腔卫生）、护理学（助产）、医学检验、口腔医学技术（口腔工艺技术）、药学、眼视光技术、医学影像技术、医学营养（食品卫生）、药学、市场营销（医药营销）和计算机技术及应用等。

学校秉承原上海第二医科大学“博极医源，精勤不倦”的文化和传统，学科专业齐全，师资力量雄厚，教学设施先进。学校拥有全市一流的上海现代护理公共实训中心、上海现代医学检验公共实训中心和正在筹建中的口腔医学技术公共实训中心，以及70余间先进的基础与专业实验室。学校还拥有数字化网络信息中心、演讲厅、报告厅、多媒体计算机室与语音室等。

学校以瑞金医院、仁济医院、新华医院、上海市第九人民医院等上海交通大学医学院附属医院和上海各大三级甲等医院为临床实践基地，实习基地还广泛分布于全市社区医疗保健机构、科研院校、高科技生物医药企业单位、牙防所、各大眼镜公司、各级食品卫生监督机构及各类食品加工企业等相关行业。